Účetnictví na Shopify

1. 8. 2026
Účetnictví na Shopify

Napojení účetnictví a fakturace na Shopify ušetří českým e-shopům hodiny ruční práce – automaticky vystaví fakturu ke každé objednávce, ohlídá zaplacení a data předá do účetního systému. Nejčastěji se na Shopify řeší Fakturoid (online fakturace) a účetní systém POHODA, a to bez přepisování objednávek mezi systémy.

V tomto návodu si projdeme, proč účetnictví na Shopify automatizovat, jak funguje napojení Fakturoidu i POHODY, co vám integrace přinese a na co si dát pozor u DPH a číselných řad.

Klíčové body

  • Fakturoid se na Shopify napojuje přes aplikaci a otevřené API – faktury vznikají automaticky k objednávkám.
  • Integrace umí párovat platby, hlídat zaplacení a posílat faktury e-mailem.
  • POHODA se propojuje přes XML / mServer nebo middleware – přenos objednávek, faktur i skladu.
  • Automatizace šetří čas a snižuje chyby v účetnictví.
  • Hlídejte správné sazby DPH, číselné řady a měny.

Obsah článku

Proč napojit účetnictví na Shopify

Bez napojení znamená každá objednávka ruční vystavení faktury, kontrolu platby a přepis do účetnictví – opakující se práce, která s rostoucím objemem zabere hodiny týdně a přináší chyby. Automatizace tohle řeší: faktura vznikne sama, platba se spáruje a data putují do účetního systému. Vy se místo administrativy věnujete prodeji a máte jistotu, že doklady sedí. Napojení účetnictví tak není jen technická vychytávka, ale jedno z rozhodnutí, které rostoucímu e-shopu nejvíc uleví od každodenní rutiny.

Automatizace se navíc vyplatí i o účetní uzávěrce a při kontrolách. Když doklady vznikají konzistentně a jsou průběžně párované s platbami, máte v účetnictví pořádek po celý rok a nemusíte nic dohledávat zpětně. Čím víc objednávek denně odbavujete, tím výrazněji se ruční fakturace stává úzkým hrdlem – a tím dřív se napojení zaplatí.

Fakturoid na Shopify

Fakturoid je oblíbená česká online fakturace a na Shopify se napojuje přes aplikaci postavenou nad jeho otevřeným API. Po instalaci aplikaci propojíte se svým účtem ve Fakturoidu, vyberete bankovní účet a nastavíte, kdy se mají faktury vytvářet – hned po objednávce, nebo až po zaplacení.

Integrace pak automaticky vytváří faktury k objednávkám, páruje je s platbami, hlídá jejich zaplacení a umí je posílat zákazníkům e-mailem. Výsledkem je fakturace, která běží sama na pozadí.

Fakturoid je díky cloudové povaze na Shopify obvykle nejrychlejší cesta, jak fakturaci zautomatizovat. Hodí se pro e-shopy, které chtějí mít doklady v pořádku bez investice do složité infrastruktury, a zvládne i odesílání výzev k platbě nebo upomínek. Pro většinu malých a středních českých e-shopů je to praktický výchozí bod.

POHODA na Shopify

POHODA od společnosti Stormware je jeden z nejrozšířenějších českých účetních a skladových systémů, který používá řada firem napříč obory. Propojení se Shopify se obvykle řeší přes XML rozhraní / mServer nebo přes middleware, který mezi oběma systémy přenáší data. Přenášet lze objednávky, faktury, stavy skladu i zákazníky, takže účetnictví a sklad zůstávají v souladu s e-shopem.

Protože POHODA běží typicky lokálně nebo na serveru, je napojení technicky náročnější než u cloudového Fakturoidu – nastavení propojení a mapování dat je proto vhodné svěřit zkušenému vývojáři.

Co napojení umožní

Automatické faktury. Ke každé objednávce vznikne doklad bez ručního zásahu.

Párování plateb. Systém spojí platbu s objednávkou a označí ji jako zaplacenou.

Odesílání dokladů. Faktury putují zákazníkům automaticky e-mailem.

Synchronizace skladu. U POHODY lze držet sklad a dostupnost v souladu s e-shopem.

Přehled pro účetní. Data jsou v účetním systému připravená, bez ručního přepisování.

Fakturoid, nebo POHODA: pro koho

Fakturoid je ideální pro menší a střední e-shopy, které chtějí jednoduchou cloudovou fakturaci s rychlým napojením. POHODA sedí firmám, které už účetnictví a sklad v POHODĚ vedou a potřebují e-shop napojit na stávající procesy. Řada firem obojí kombinuje – podle toho, kde vedou účetnictví a jak složité mají skladové hospodářství.

Při rozhodování zvažte, kdo bude s doklady pracovat. Pokud účetnictví řeší externí účetní přes Fakturoid, je volba jasná. Pokud máte vlastní účetní oddělení zvyklé na POHODU a rozsáhlý sklad, vyplatí se investovat do robustnějšího napojení. V obou případech je cílem stejný výsledek: žádné ruční přepisování a doklady, které sedí.

Krok za krokem: napojení Fakturoidu na Shopify

  1. Instalace aplikace. Do Shopify přidáte aplikaci pro napojení Fakturoidu a potvrdíte instalaci.
  2. Propojení s účtem. Aplikaci propojíte se svým účtem ve Fakturoidu, kterému tím udělíte přístup.
  3. Výběr bankovního účtu a vložení webhook adresy z Fakturoidu.
  4. Nastavení okamžiku fakturace – hned po objednávce, nebo až po zaplacení.
  5. Nastavení číselných řad, sazeb DPH a měn, aby doklady seděly.
  6. Testovací objednávka pro ověření, že se faktura vytvoří, spáruje s platbou a odešle e-mailem.

Po nastavení běží fakturace automaticky – ke každé objednávce vznikne doklad bez ručního zásahu.

Fakturoid vs POHODA: srovnání

Kritérium Fakturoid POHODA
Typ Online (cloud) Desktop / server
Napojení na Shopify Aplikace + API XML / mServer / middleware
Náročnost nasazení Nízká Vyšší (vhodný vývojář)
Sklad Omezeně Rozsáhlé skladové hospodářství
Vhodné pro Malé a střední e-shopy Firmy s vlastní účtárnou a skladem

Zjednodušeně: pokud chcete rychlé a jednoduché řešení fakturace, sáhněte po Fakturoidu. Pokud už vedete účetnictví a sklad v POHODĚ a potřebujete e-shop napojit na stávající procesy, dává smysl robustnější napojení POHODY.

Co se stalo s EET

Možná ještě narazíte na zmínky o EET (elektronická evidence tržeb) v souvislosti s fakturací. Pro pořádek: EET bylo v Česku zrušeno a evidovat tržby přes tento systém už není potřeba. Pokud tedy někde uvidíte návod na napojení EET, není dnes relevantní. Vaší povinností zůstává správné vystavování dokladů a odvod DPH – a právě to řeší napojení Fakturoidu nebo POHODY.

DPH, OSS a číselné řady v praxi

Kolem účetnictví na e-shopu jsou tři věci, které se vyplatí ohlídat hned na začátku. První jsou správné sazby DPH u produktů – základní a snížená sazba musí sedět, jinak odvedete špatnou daň. Druhou je režim OSS při prodeji koncovým zákazníkům do EU, který umožní odvádět DPH podle cílové země přes jedno přiznání; napojení fakturace musí tyto sazby správně přebírat. Třetí jsou číselné řady – konzistentní číslování faktur bez duplicit, zvlášť když doklady vznikají automaticky.

Tyto věci spolu souvisí a je dobré je nastavit společně, aby doklady byly správné napříč e-shopem i účetnictvím. 

Kolik času automatizace ušetří

Přínos napojení účetnictví se nejlépe ukáže na běžném provozu. Bez automatizace znamená každá objednávka ruční vystavení faktury, kontrolu platby na účtu a její spárování, případně odeslání dokladu zákazníkovi. U deseti objednávek denně je to otravné, u padesáti a více se z toho stává práce na celý úvazek – a přitom nejde o činnost, která by e-shopu přinášela tržby.

S napojeným Fakturoidem nebo POHODOU tyhle kroky odpadnou. Faktura vznikne automaticky, platba se spáruje a doklad se odešle sám. Účetní pak místo přepisování dat jen kontroluje a uzavírá, což šetří čas i náklady na externí zpracování. Čím víc objednávek odbavujete, tím dřív se napojení zaplatí – a to nepočítáme hodnotu toho, že máte v dokladech pořádek po celý rok.

Jak automatizace snižuje chyby

Ruční přepisování je nejčastějším zdrojem chyb v účetnictví e-shopu – překlep v částce, špatná sazba DPH, zapomenutá faktura nebo duplicitní číslo dokladu. Každá taková chyba znamená práci navíc při dohledávání a opravách, v horším případě problém při kontrole.

Automatické napojení tyhle chyby výrazně omezuje, protože data putují mezi Shopify a účetnictvím bez lidského zásahu a podle jednou nastavených pravidel. Doklady mají konzistentní číselné řady, správné sazby i navázané platby. Výsledkem je nejen ušetřený čas, ale hlavně klid – víte, že účetnictví sedí a nemusíte na konci měsíce nic ručně dohledávat.

Na co si dát pozor

  • Sazby DPH. Ověřte správné sazby a jejich promítnutí do dokladů, zvlášť u prodeje do EU (režim OSS).
  • Číselné řady. Nastavte konzistentní číslování faktur, ať nevznikají duplicity.
  • Měny. U prodeje v cizích měnách pohlídejte kurzy a zaokrouhlení.
  • Okamžik vystavení. Rozmyslete, zda fakturovat po objednávce, nebo až po zaplacení.

Kdy napojení účetnictví řešit

Ideální je myslet na napojení účetnictví už při stavbě nebo migraci e-shopu – nastavení sazeb DPH, číselných řad a fakturace se pak zapojí do celku od začátku a nemusíte nic předělávat. Pokud e-shop už běží a fakturaci řešíte ručně, je dobrým signálem k napojení chvíle, kdy vám administrativa kolem dokladů začne ukrajovat čas, který byste raději věnovali prodeji.

Rozhodně nečekejte, až se z ruční fakturace stane každodenní zátěž nebo zdroj chyb. Napojení se dá nasadit i za provozu bez výpadku prodeje – u Fakturoidu jde o rychlé řešení, u POHODY je potřeba počítat s náročnějším nastavením. V obou případech platí, že čím dřív automatizaci zavedete, tím víc času a nervů ušetříte a tím dřív budete mít v účetnictví pořádek.

Ať už zvolíte kterékoli řešení, doporučujeme napojení nechat nastavit a otestovat najednou, ideálně společně s ostatními integracemi e-shopu. Účetnictví totiž navazuje na platby, dopravu i DPH – a když spolu všechny části ladí, běží e-shop hladce a bez zbytečné ruční práce.

Jak vypadá automatizovaná fakturace v praxi

Představte si běžný den e-shopu s napojenou fakturací. Zákazník dokončí objednávku a zaplatí. V tu chvíli se na pozadí automaticky vytvoří faktura se správnou sazbou DPH a číslem z připravené číselné řady. Jakmile platba dorazí na účet, systém ji spáruje s objednávkou a označí ji jako uhrazenou. Doklad se zákazníkovi odešle e-mailem, aniž byste hnuli prstem.

Vy nebo vaše účetní pak místo přepisování jen kontrolujete a na konci období uzavíráte. Když se objeví vratka, vystaví se opravný doklad podle stejných pravidel. Celý koloběh běží spolehlivě a bez ručních zásahů, takže se můžete soustředit na prodej a péči o zákazníky. Přesně tohle je hodnota napojení účetnictví – ne jedna ušetřená faktura, ale celý proces, který se o sebe stará sám a nedělá chyby.

Účetnictví jako součást celého e-shopu

Fakturace nestojí na e-shopu osamoceně – navazuje na platby, dopravu i daně. Faktura musí sedět s tím, jak zákazník zaplatil, jakou zvolil dopravu a jaká sazba DPH na produkt patří. Proto se vyplatí dívat se na účetnictví jako na jeden díl většího celku, ne jako na izolovanou integraci.

Když spolu všechny části ladí, běží e-shop hladce: objednávka se zaplatí, expeduje, vyfakturuje a zaúčtuje, aniž byste do toho museli zasahovat. Právě propojení účetnictví s ostatními integracemi (platby, dopravci, DPH a OSS) dělá z e-shopu systém, který se z velké části řídí sám. Přesně na takové provázané nastavení se jako Shopify agentura zaměřujeme – aby jednotlivé části netvořily ostrůvky, ale spolupracovaly.

Často kladené dotazy (FAQ)

Jde napojit Fakturoid na Shopify?

Ano. Fakturoid se napojuje přes aplikaci postavenou na jeho API. Faktury pak vznikají automaticky k objednávkám, párují se platby a doklady se posílají e-mailem.

Lze Shopify propojit s POHODOU?

Ano, obvykle přes XML / mServer nebo middleware. Přenášet lze objednávky, faktury, sklad i zákazníky. Napojení je technicky náročnější a je vhodné ho svěřit vývojáři.

Vystaví se faktura automaticky?

Ano. Nastavíte, zda se doklad vytvoří hned po objednávce, nebo až po zaplacení, a integrace ho vystaví bez ručního zásahu.

Zvládne napojení prodej do EU a DPH?

Ano, ale je potřeba správně nastavit sazby DPH a případně režim OSS pro prodej do EU. To ohlídáme při nastavení integrace.

Musím platit za propojení zvlášť?

U aplikací třetích stran obvykle ano – napojení je samostatný produkt nad rámec samotného Fakturoidu či POHODY. Konkrétní model závisí na zvoleném řešení.

Musím ještě řešit EET?

Ne. EET bylo v Česku zrušeno, takže tržby přes tento systém už neevidujete. Řešíte pouze správné vystavování dokladů a odvod DPH.

Jak dlouho trvá napojení Fakturoidu?

U standardního e-shopu jde o krátké nasazení – instalace aplikace, propojení účtu a nastavení. Napojení POHODY je náročnější a je vhodné ho svěřit vývojáři.

Vystaví napojení i opravné doklady a dobropisy?

Podle zvoleného řešení a nastavení ano. Vratky a opravné doklady je dobré při napojení promyslet, aby i storna a dobropisy vznikaly konzistentně a účetnictví sedělo.

Zvládne napojení faktury v cizí měně?

Ano, ale je potřeba správně nastavit měny, kurzy a zaokrouhlení. To ošetříme při nastavení integrace.

Chcete mít fakturaci na Shopify automatickou?

Napojíme vám Fakturoid nebo POHODU na Shopify tak, aby faktury vznikaly samy a účetnictví sedělo. Podívejte se na naši tvorbu a integrace e-shopů na Shopify nebo si domluvte konzultaci zdarma.

Zdroje

Autor: Miroslav Volovec, CEO 3NODE Software s.r.o. — specialisté na vývoj a integrace e-shopů na platformě Shopify.